El Convenio cuenta con tres mecanismos de facilitación:

• el mecanismo de facilitación del Convenio,
• el Centro de Intercambio de Información sobre Seguridad de la Biotecnología (CIISB) del Protocolo de Cartagena y
• el Centro de Intercambio de Información sobre Acceso y Participación en los Beneficios (Centro de Intercambio de Información sobre APB) del Protocolo de Nagoya.

El Mecanismo de facilitación del Convenio sobre la Diversidad Biológica (disponible en http://www.cbd.int/chm/) se estableció de conformidad con el  artículo 18 3)  del Convenio para promover y facilitar la cooperación científica y técnica en relación con todos los aspectos de la biodiversidad. Es una plataforma única y unificada que también da soporte a los mecanismos de facilitación específicos del Protocolo de Cartagena sobre Seguridad de la Biotecnología (CIISB) y el Protocolo de Nagoya (el Centro de Intercambio de la Información sobre APB). Se puede acceder a todos los mecanismos de facilitación con la misma cuenta que se utiliza para el CDB, que puede obtenerse en https://accounts.cbd.int/signup. No obstante, cada mecanismo de facilitación tiene un portal específico en el que puede buscarse y registrarse información con objeto de responder a las necesidades concretas de las Partes en relación con la aplicación de los diferentes tratados.

El CIISB fue establecido en el artículo 20 del Protocolo de Cartagena sobre Seguridad de la Biotecnología, y se centra en la información que debe intercambiarse en el marco del Protocolo. El Centro de Intercambio de Información sobre APB (al que puede accederse en https://absch.cbd.int/ fue creado a partir del artículo 14del Protocolo de Nagoya y se centra en la información que debe intercambiarse en el marco del Protocolo de Nagoya. Una de las diferencias principales con el Mecanismo de facilitación es que en los dos centros de intercambio de información se menciona una diversidad de categorías de información que las Partes en cada uno de los Protocolos están jurídicamente obligadas a proporcionar a través del CIISB y el Centro de Intercambio de Información sobre APB, respectivamente. No existe el mismo requisito jurídico de que las Partes en el Convenio faciliten información a través del Mecanismo de facilitación. Por este motivo, los portales del Centro de Intercambio de la Información sobre APB y el CIISB poseen algunas características y funciones específicas.

Los formatos comunes y las reglas operativas tienen que ser compatibles entre mecanismos de facilitación y, de ser posible, estar armonizados entre ellos. Los formatos comunes elaborados para el CIISB emplean, en la medida de lo posible, textos predefinidos o vocabularios controlados que son compatibles con los vocabularios controlados del Mecanismo de facilitación y el Centro de Intercambio de Información sobre APB.

Modalidades conjuntas de funcionamiento

En la decimocuarta reunión de la Conferencia de las Partes (COP 14) en el Convenio sobre la Diversidad Biológica (celebrada en Sharm El-Sheikh, Egipto, del 17 al 29 de noviembre de 2018), las Partes aprobaron las modalidades conjuntas de funcionamiento del Mecanismo de facilitación del CDB, el CIISB y el Centro de Intercambio de Información sobre APB. Asimismo, las modalidades conjuntas fueron aprobadas por la Conferencia de las Partes que actúa como reunión de las Partes en el Protocolo de Cartagena en la decisión CP-9/2, así como por las Partes en el Protocolo de Nagoya en la decisión NP-3/3. 

La finalidad de las modalidades conjuntas de funcionamiento es garantizar la falta de contradicción entre las plataformas y fortalecer la coherencia e integración entre los tres mecanismos de facilitación principales del Convenio, preservando, al mismo tiempo, las funciones específicas de cada uno de ellos. Las modalidades conjuntas de funcionamiento pueden encontrarse en el Anexo a la decisión 14/25 de la COP.