Las modalidades de operación del CIISB requieren usar sistemas de identificación única existentes para los organismos vivos modificados, según corresponda, para facilitar la búsqueda y recuperación de la información.

Actualmente, el único sistema de identificación que está disponible a través del CIISB es el Identificador único de plantas transgénicas de la OCDE (véase la revisión de 2006 de la Orientación de la OCDE para la designación de un identificador único de vegetales transgénicos (ENV/JM/MONO(2002)7/REV1), publicada por la OCDE en febrero de 2002 y revisada en noviembre de 2006.

Se trata de un código alfanumérico sencillo que se asigna a cada vegetal vivo modificado que se ha aprobado para uso comercial, incluido su uso como alimento humano o animal. La orientación se ha diseñado para que los encargados de desarrollar un nuevo vegetal transgénico puedan generar un identificador e incluirlo en expedientes que luego enviarán a las autoridades nacionales durante el proceso de evaluación de seguridad. Una vez aprobado, las autoridades nacionales pueden luego enviar este identificador único a la Secretaría de la OCDE, para que lo incluya en su base de datos de productos, a partir de la cual, automáticamente, se envía la información al Centro de Intercambio de Información sobre Seguridad de la Biotecnología.

El identificador único es un código de nueve dígitos, compuesto por tres elementos separados por guiones (-). Estos son:

• 2 o 3 dígitos alfanuméricos para designar al solicitante;
• 5 o 6 dígitos alfanuméricos para designar el evento de transformación;
• 1 dígito numérico para verificación (su propósito es reducir errores al garantizar la integridad del código alfanumérico).

Se pueden adoptar dos enfoques en relación con los productos creados con más de un evento de transformación (se suelen denominar eventos de transformación "apilados"), cuando estos fueron previamente aprobados para su comercialización. Un solicitante puede elegir generar un identificador único nuevo para dichos productos o bien utilizar una combinación de los identificadores únicos de los productos cuya comercialización ha sido previamente aprobada.

Códigos comunes de los solicitantes